El Área Académica de Probabilidad y Estadística del CIMAT (DAPyE-CIMAT) se fundó en 1990 cuando el CIMAT también constituyó las otras áreas académicas actuales. Tiene sus orígenes en 1986, cuando varios académicos en estadística y probabilidad comenzaron a llegar al CIMAT. La Maestría en Estadística en Guanajuato inició en 1988 y fue el primer posgrado en el que participó el CIMAT.  

Hoy en día, las actividades del DAPyE-CIMAT son la investigación y la formación de recursos humanos de alto nivel, así como la vinculación y la organización de eventos en estadística y probabilidad, actividades organizadas en programas.